APEER

APEER, désormais intégré à l'écosystème arivis Cloud, est une plateforme révolutionnaire conçue pour rendre l'analyse d'images avancée et pilotée par l'IA accessible à la communauté scientifique, en particulier dans les domaines des sciences de la vie, de la biologie et de la biotechnologie. Elle s'attaque au goulot d'étranglement critique de l'analyse manuelle des images dans la recherche, qui est souvent chronophage, subjective et difficile à mettre à l'échelle. En fournissant un environnement cloud intuitif, APEER permet aux chercheurs d'automatiser des tâches d'analyse complexes, transformant les images brutes de microscopie en données quantitatives et reproductibles, sans nécessiter aucune expertise en programmation.

La plateforme est basée sur des algorithmes de deep learning de pointe, permettant aux utilisateurs de s'attaquer à des problèmes de segmentation difficiles, voire impossibles à résoudre avec les méthodes traditionnelles. Qu'il s'agisse d'identifier des cellules individuelles dans une culture dense, de compter les synapses dans des images neuronales ou de quantifier les puncta dans des études sur l'autophagie, APEER fournit les outils pour construire et déployer des modèles d'IA personnalisés adaptés aux besoins spécifiques de la recherche.

Comment utiliser APEER

APEER est conçu avec un flux de travail guidé et convivial qui simplifie le processus de création et d'application de modèles d'IA sophistiqués. Le processus typique comprend plusieurs étapes simples :

1. Télécharger les données : Les utilisateurs commencent par télécharger en toute sécurité leurs images de microscopie sur la plateforme cloud. Le système prend en charge divers formats d'images courants utilisés dans la recherche scientifique.
2. Annoter : Pour entraîner un modèle personnalisé, l'utilisateur doit apprendre à l'IA ce qu'elle doit rechercher. Cela se fait via une interface d'annotation intuitive, où l'utilisateur délimite ou marque simplement quelques exemples représentatifs des objets d'intérêt (par exemple, cellules, noyaux, synapses).
3. Entraîner le modèle : Avec les annotations fournies, l'utilisateur peut lancer le processus d'entraînement du modèle en un seul clic. La puissante infrastructure cloud d'APEER gère tous les calculs complexes, entraînant un modèle de deep learning (pour la segmentation sémantique ou d'instance) basé sur les exemples fournis.
4. Appliquer et automatiser : Une fois le modèle entraîné et validé, il peut être appliqué pour analyser automatiquement de grands lots d'images. Cela crée un flux de travail standardisé et reproductible qui peut traiter des milliers d'images, économisant des centaines d'heures de travail manuel.
5. Examiner et exporter : La plateforme fournit des outils pour examiner les résultats de l'analyse. Les données quantitatives, telles que le nombre d'objets, leurs tailles et leurs intensités, peuvent ensuite être facilement exportées pour une analyse statistique plus approfondie et une publication.

Fonctionnalités principales de APEER

• Segmentation alimentée par l'IA : Utilise le deep learning avancé pour la segmentation sémantique (classification au niveau du pixel) et d'instance (détection et séparation d'objets).
• Entraînement de modèles d'IA sans code : Un flux de travail intuitif et guidé permet aux chercheurs sans formation en informatique d'entraîner leurs propres modèles d'IA personnalisés.
• Plateforme basée sur le cloud : Élimine le besoin de matériel local coûteux. Fournit un stockage de données sécurisé, de puissantes capacités de traitement et une accessibilité depuis n'importe où.
• Flux de travail automatisés : Permet la création de pipelines d'analyse de bout en bout pour traiter de grands ensembles de données avec un débit et une cohérence élevés.
• Reproductibilité : Garantit que l'analyse est objective et comparable entre différents utilisateurs, équipes et expériences, améliorant ainsi la fiabilité des résultats de la recherche.
• Collaboration : En tant que plateforme cloud, elle facilite le partage de données, de modèles et de flux de travail entre les membres de l'équipe et les collaborateurs.

Cas d'utilisation pour APEER

APEER est polyvalent et peut être appliqué à un large éventail d'applications d'imagerie biologique :

• Neurosciences : Automatisation du processus fastidieux de comptage des synapses dans les images de neurones, permettant aux chercheurs d'étudier la connectivité neuronale à grande échelle.
• Biologie cellulaire : Analyse des processus cellulaires comme l'autophagie en détectant et en quantifiant automatiquement les puncta, comme l'ont démontré des chercheurs du JNCASR.
• Oncologie : Segmentation et comptage des cellules cancéreuses dans des échantillons de tissus pour évaluer la morphologie de la tumeur ou l'efficacité des traitements.
• Découverte de médicaments : Criblage à haut débit de composés en analysant automatiquement leurs effets sur des cultures cellulaires à partir de milliers d'images.

Avantages de APEER

La plateforme offre des avantages significatifs par rapport aux méthodes d'analyse manuelles ou traditionnelles. Les utilisateurs rapportent avoir économisé des centaines d'heures, ce qui leur permet de se concentrer sur des questions scientifiques de plus haut niveau plutôt que sur un comptage fastidieux. Elle augmente considérablement le débit, permettant l'analyse de milliers de cellules par jour au lieu de quelques dizaines seulement. De plus, elle élimine le biais subjectif inhérent à l'analyse manuelle, conduisant à des données hautement reproductibles et fiables. En démocratisant l'accès au deep learning, APEER permet à tout biologiste ou chercheur de réaliser des analyses d'images de pointe.

Tarification et plans

APEER (dans le cadre d'arivis Cloud) propose un essai gratuit pour les nouveaux utilisateurs afin d'explorer les capacités de la plateforme. Pour une utilisation continue et un accès à toutes les fonctionnalités, il fonctionne sur un modèle basé sur un abonnement. Les détails de tarification spécifiques sont généralement fournis sur demande pour répondre aux besoins variés des laboratoires universitaires, des instituts de recherche et des entreprises de biotechnologie. Les utilisateurs intéressés sont encouragés à contacter leur équipe de vente pour obtenir un devis personnalisé.