Variational AI 概览
Variational AI 是一家处于人工智能和生物技术交叉领域的先驱公司,致力于加速药物发现过程。该公司成立于2019年,开发了 Enki™,这是首个商业上可用的、专门用于设计新颖小分子的基础模型。这个强大的生成式AI平台使生物制药公司能够以前所未有的速度和效率从靶点识别转向临床前测试,从根本上改变了开发新疗法的成本和时间动态。
Variational AI 的方法不是筛选数百万个现有化合物,而是从头开始创造新的化合物。Enki™ 平台基于数十年的实验数据进行训练,涵盖了超过10个主要靶点类别中的570多个靶点,包括GPCR、激酶、蛋白酶和NHR。这种广泛的训练使模型能够理解分子相互作用和化学的复杂规则,从而能够生成具有特定、期望属性的分子。
如何使用 Variational AI
Enki™ 平台的工作流程设计得既简单又精确,让药物化学家和计算化学家能够将其战略目标直接转化为候选分子。
- 定义目标产品概况 (TPP): 流程始于用户定义一个清晰的TPP。这是最关键的一步,用于指定最终候选药物的期望特性。
- 选择靶点和脱靶靶点: 用户指定分子应与之相互作用的主要生物靶点(靶上靶点),同样重要的是,指定应避免的靶点(脱靶靶点),以最大限度地减少副作用并提高选择性。
- 指定理化性质: 除了靶点结合,用户还可以定义其他关键属性,如溶解度、渗透性、代谢稳定性,甚至针对中枢神经系统药物的脑渗透性。
- 生成和优先排序: 一旦定义了TPP,Enki™ 就会开始工作。其生成算法探索广阔的化学空间,设计出符合多属性要求的新颖分子。然后,它会提供一个按优先级排序的最有希望的候选分子列表,从而大大减少需要合成和测试的化合物数量。
Variational AI 的核心功能
- 生成式基础模型 (Enki™): 一种最先进的生成式算法,它创造而非仅仅搜索新颖的小分子。
- 广泛的训练数据: 基于涵盖超过570个靶点和10多个靶点类别的海量数据集进行训练,确保了广泛的适用性。
- 数据独立操作: 一个关键优势是它能够为几乎没有或根本没有实验数据的新靶点生成分子。
- 多属性优化: 同时优化靶上效力、脱靶选择性以及理想的ADME(吸收、分布、代谢和排泄)属性。
- 快速先导化合物生成: 能够在短短数周内提供新颖且具有选择性的先导结构,而传统上这一过程需要数月甚至数年。
- 高效发现: 经证实效率极高,案例研究表明,一小组AI生成的分子可能比通过传统方法筛选一百万个化合物更有效。
Variational AI 的使用案例
Variational AI 与各治疗领域的生物制药合作伙伴合作,共同应对具有挑战性的药物发现项目。
- 肿瘤学: Variational AI 与 Rakovina Therapeutics 合作,使用 Enki™ 加速发现一种可穿透血脑屏障的ATR抑制剂,这是治疗已转移至脑部的癌症的一个具有挑战性的目标。
- 免疫学与炎症: 公司正与 Oncocross 合作,共同开发一种用于治疗慢性皮肤炎症,特别是特应性皮炎的新型小分子抑制剂。
- 免疫肿瘤学: ImmVue Therapeutics 选择 Variational AI 的平台来发现首创的抗癌药物,利用 Enki™ 为免疫肿瘤学靶点生成新颖分子。
Variational AI 的优势特点
该平台提供了与传统药物发现方法不同的范式,带来了显著的竞争优势。
- 速度: 大大缩短了从苗头化合物识别到先导化合物优化的时间线。
- 成本效益: 通过最大限度地减少对昂贵且耗时的高通量筛选 (HTS) 的需求,降低了早期发现阶段的总体成本。
- 创新性: 生成真正新颖的化学物质,为之前“不可成药”的靶点开辟了新的知识产权机会和药物开发途径。
- 更高的成功率: 通过从一开始就设计具有更优属性的分子,增加了候选药物在后期临床前和临床阶段成功的可能性。
定价和计划
Variational AI 采用合作与协作的商业模式。定价不公开,根据项目范围、治疗领域和合作性质进行定制。这通常涉及共同开发协议、Enki™ 平台的许可或基于里程碑的付款。我们鼓励有兴趣的生物制药公司直接联系该公司,讨论潜在的合作机会。
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Variational AI 替代方案
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1910genetics
1910genetics是一家生物技术公司,通过其多模态AI平台ITO™彻底改变药物发现。该平台由实验室自动化驱动,加速小分子和大分子疗法的设计,旨在使以往无法成药的靶点变得可治疗,以应对癌症、神经系统疾病或自身免疫性疾病等。
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Cradle
Cradle 是一个由人工智能驱动的平台,专为科学家和生物技术公司设计,旨在更快地设计出更好的蛋白质。通过利用生成式人工智能和机器学习,它帮助生成新的候选蛋白质并优化其特性,如稳定性、活性和结合亲和力。该平台从您的实验数据中学习,从而在更少的实验室实验中实现更多突破,并将开发时间从数年显著缩短至数个季度。
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Verge Genomics
Verge Genomics是一家生物技术公司,利用其“全人类”(all-in-human)人工智能平台CONVERGE®来发现和开发针对复杂疾病的药物。通过分析庞大的人类基因组数据集,它旨在加速为肌萎缩侧索硬化症(ALS)、帕金森病和额颞叶痴呆等疾病创造有效疗法,将药物从发现到临床的速度远超传统方法。
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Ligo Biosciences
Ligo Biosciences是一家研究驱动型公司,利用生成式AI模型为工业应用设计新型酶。该公司源于牛津大学,为制药、精细化工和食品安全领域创造定制的生物催化剂,突破了天然酶的局限,加速了创新进程。
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Tamarind Bio
Tamarind Bio 是一个先进的计算平台,致力于普及蛋白质工程。它为科学家提供了用户友好的界面和强大的API,以便访问如AlphaFold和RFdiffusion等顶尖的AI和基于物理的工具。该平台简化了蛋白质设计、抗体工程和酶优化流程,并负责所有高性能计算和资源调度。这使得研究人员能够大规模设计新分子和改良生物变体,从而在无需专业计算知识的情况下加速生命科学领域的发现。
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Ginkgo Bioworks
Ginkgo Bioworks 是一家领先的合成生物学公司,利用人工智能、自动化和庞大的生物学代码库进行细胞编程。他们为制药、农业和工业制造领域的合作伙伴设计定制微生物,从而加速生物研发并实现新产品的可持续生产。
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Ginkgo Bioworks 是一个领先的生物技术平台,利用人工智能、自动化和数据分析来编程细胞,以适应广泛的应用。它提供“生物即服务”,帮助制药、农业和工业领域的合作伙伴加速研发并开发新型生物基产品。
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Reshape Biotech
Reshape Biotech 提供一个由人工智能驱动的实验室自动化平台,该平台结合了自动化成像硬件和基于云的分析系统。它专为生物技术、农业和食品科学领域的研发及质控实验室设计,可实现培养皿成像自动化、利用人工智能分析实验并生成结构化、可复现的数据,从而显著加速研发周期。
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Culture Biosciences
Culture Biosciences 提供一个基于云的生物制造平台,利用人工智能和自动化加速生物工艺开发。它提供对先进生物反应器的远程访问,使科学家能够从任何地方设计、运行、监控和分析实验,从而显著缩短研发周期并加快新生物产品的上市时间。
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